U wordt voor een allogene stamceltransplantatie altijd een aantal weken opgenomen in een academisch ziekenhuis, bijvoorbeeld het Radboudumc. U krijgt eerst een kuur met een hoge dosis chemotherapie. Met de hoge dosis chemotherapie proberen we de nog achtergebleven kwaadaardige cellen te doden. Hierbij raken ook de eigen beenmerg- en bloedcellen blijvend beschadigd.

Na deze intensieve behandeling met chemotherapie krijgt u de stamcellen (die eerder bij de donor zijn afgenomen) om dit probleem op te kunnen vangen. Deze cellen groeien uiteindelijk weer uit tot goed werkend beenmerg- en bloedcellen.